FORPLANTA

PFLANZEN FIT FüR DIE ZUKUNFT

Modul 4: Bioinformatik

Arbeitsfeld:

Modulverantwortlicher: Prof. Jürgen Soll
Beteiligte Projektgruppen: Prof. Uwe Sonnewald und Prof. Jürgen Soll

Um die in Modul III erhobenen Daten zusammenzuführen soll eine  projektspezifischen Datenbank erstellt und die darin gesammelten Daten vergleichend analysiert werden. Basierend auf den Ergebnissen der Bioinformatik können regulatorische Netzwerke und metabolomische Prozesse die positiv mit einer erhöhten Stresstoleranz korrelieren, visualisiert werden. Die zum Transkriptom, Metabolom und Proteom erfassten Daten werden für die jeweiligen Stressbedingungen in einem Arbeitsmodell integriert so dass sich Zusammenhänge und veränderte Metaboliteinflüsse im Vergleich zu den jeweiligen Wildtypen, Ökotypen und ambienten  Bedingungen erkennen lassen. Die Daten sollen damit letztendlich zur Modellierung von Metaboliteinflüssen genutzt werden.

Schlagworte:
- Bioinformatik: Datenbank