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BAVARIAN RESEARCH ASSOCIATION INTERACTION OF HUMAN BRAIN CELLS

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Interest on Scanpy- an invitation to San Francisco for the group of Fabian Theis

02/12/2019

The Python based software scanpy, developed in the group of Fabian Theis, attracted the attention of CZ Biohub.

The advent of single-cell RNA sequencing technologies was key to open a new chapter of single cell biology. However, dealing with the transcriptome of thousands of cells boosted the demand of new software tools. One of these data analysis toolboxes is scanpy, a fast and scalable Python-based software developed in the group of Fabian Theis. Recently, the CZ Biohub, a non-profit organisation funded by the Chan Zuckerberg Initiative (CZI), invited David Fischer and Maren Büttner to lead a 2 day workshop on single cell data analysis in scanpy in San Francisco, California.

Die Technologie der Einzelzell RNA Sequenzierung eröffnete ein neues Kapitel in der Erforschung der Biologie von einzelnen Zellen. Die Untersuchung des Transkriptoms von Tausenden von Zellen erforderte aber auch neue Software „Werkzeuge“. Eines dieser „Werkzeuge“ für die Datenanalyse ist die schnelle und skalierbare Python-basierter Software Scanpy, die von der Arbeitsgruppe von Fabian Theis entwickelt wurde.  CZ Biohub, eine von der Chan Zuckerberg Initiative (CZI) gegründete  gemeinnützige Organisation, hat kürzlich David Fischer und Maren Büttner aus der Theis Gruppe nach Kalifornien eingeladen um im San Francisco einen zweitätigen Workshop zum Thema Datenanalyse von Einzelzellen mit Scanpy zu leiten. 

Information

Launching date

03.2019

End

02.2023

Funded by

Bavarian State Ministry of Science and the Arts